كليات جامعة وادي النيل
كلية الدراسات العليا

أسست كلية الدراسات العليا كوحدة عام 1994م بمدينة عطبرة بهدف تنظيم وتشجيع البحث العلمي بالتنسيق مع كليات الجامعة من خلال تنفيذ برامج الدبلوم
كلية الهندسة والتقنية

تُعد كلية الهندسة والتقنية إحدى أعرق الكليات الهندسية بالسودان؛ إذ تأسست عام 1971 تحت اسم معهد فنيي الهندسة الميكانيكية (IMET) بهدف إعداد كوادر تقنية مؤهلة تُسهم في دفع عجلة التنمية الصناعية وتلبية احتياجات سوق العمل المتزايدة.
كلية التربية

تأسست الكلية عام 1984م كنواة لجامعة الشمال، وكانت تتبع للمجلس القومي للتعليم العالي، ثم أُشرفت عليها جامعة الخرطوم وقدمت لها كفاءات علمية. وفي عام 1990م أصبحت جزءًا من جامعة وادي النيل.
كلية الاقتصاد والعلوم الادارية

تأسست الكلية في العام 1991م باسم كلية التجارة وإدارة الأعمال في مدينة الدامر بأربع قاعات ومعمل واحد ومكتبة صغيرة و كانت الأقسام المتخصصة في ذلك الوقت هي المحاسبة، البنوك والتمويل، إدارة الأعمال، التجارة، الإحصاء والحاسوب
كلية التربية اساس

افتتحت كلية المعلمين بمسمى كلية إعداد المعلمين في أبريل 1994م بمدينة الدامر التي تبعد 310 كلم من الخرطوم، في مساحة تبلغ حوالي عشرة أفدنة، وفي أغسطس 1995م عدل مجلس الجامعة مسمى الكلية الى كلية المعلمين.
كلية الأداب

تعتبر الكلية من أوائل أربع كليات بالجامعة، اذ أنشئت مع بداية إعلان ثورة التعليم العالي والبحث العلمي في عام 1991م وتم قبول اول دفعة من الطالبات في العام 1995م في مركز الطالبات بحي الدكة بمدينة بربر وتعتمد الكلية نظام الدراسة غير المختلط.
كلية الشريعة والقانون

بدأت نشأتها كقسم من أقسام كلية العلوم الإسلامية والعربية في العام 1998م بمدينة بربر ثم تطورت فأصبحت مدرسة في العام 1999م ثم تمَّ ترفيعها في العام 2000م لتصبح كلية من ضمن كليات الجامعة. وقد تميزت بنظام الدراسة غير المختلط حيث يدرس الطلاب بمركز خاص بهم وكذا الحال بالنسبة للطالبات.
كلية الزراعة

صدر أمر تأسيس كلية الزراعة في العام 1995م وتمَّ قبول الدفعة الأولى في العام 1997م. توجد الكلية بمنطقة دارمالي (14 كيلومتر شمال مدينة عطبرة) وتمتلك مزرعة بمساحة 65.5 هكتار (156 فدان) بالإضافة إلى مشتل ومعمل متخصص لزراعة الأنسجة وعدد مقدر من البيوت المحمية.
كلية الطب والعلوم الصحية

أنشئت الكلية في العام 1997م وتم افتتاحها عام 1998م وفي نفس العام باشرت العمل بقبول الطلاب وتدريسهم في برنامج بكالريوس الطب والجراحة. في العام 2006م بدأت تنفيذ برنامج دبلوم الأطر الصحية والبرامج المنفذة حتى الآن وهي: دبلوم مساعدي طب الصيدلة ودبلوم التمريض التقني ودبلوم القبالة.
كلية علوم الحاسوب وتقانة المعلومات

أنشأت جامعة وادي النيل في العام 1994م وحدة الدراسات الإضافية والتي هدفت لتقديم برامج تعليم مستمر ودورات تدريبية ودراسات تأهيلية في برامج الدبلوم في شتى المجالات، وكان ذلك يتم بالمركز الرئيسي في عطبرة ومركز الخرطوم. في العام 2002م أُنشئت كلية العلوم والتقانة وتنمية المجتمع في مدينة عطبرة على بعد 330 كلم شمال الخرطوم بغرض التوسع في الخدمات التعليمية
كلية تنمية المجتمع

تُبدأت كلية تنمية المجتمع بجامعة وادي النيل بمدينة رسالتها بموجب قرار تأسيس كليات المجتمع لسنة 2004م الصادر من وزارة التعليم العالي والبحث العلمي وذلك إرساءً لأهداف المجتمع المحلي (IMET) بهدف إعداد كوادر تقنية مؤهلة تُسهم في دفع عجلة التنمية الصناعية وتلبية احتياجات سوق العمل المتزايدة.
كلية القران الكريم

تعتبر الكلية الأحدث نشأة بالجامعة حتى الآن، كما أنها تعتبر أنموذجاً وشاهداً إضافياً على تفاعل الجامعة مع المجتمع والعمل على الإسهام في حل قضاياه المختلفة إذ قررت الجامعة أن يكون مقر الكلية بمحلية “أبو حمد” باعتبارها مركز لكثافة العمل التعديني بولاية نهر النيل.